Für die verschiedenen Formen der digitalen Signatur kommen unterschiedliche Verschlüsselungsmethoden zum Einsatz. Ein besonderes Augenmerk liegt auf Algorithmen, PGP-Systemen, zertifikatsbasierten Systemen und zertifikatsfreien Systemen. Jede dieser Arten funktioniert nach einem anderen Prinzip, was im Folgenden näher dargestellt wird.